高速公路征地补偿有问题，该起诉哪个部门？

法律分析：高速公路征收土地补偿内容包括：1、土地补偿费；征用耕地的补偿标准，按政府规定，为该耕地年产值的若干倍，具体补偿标准由省、自治区、直辖市人民政府在此范围内制定；2、青苗补偿费和被征用土地上的房屋、水井、树木等附着物补偿费；3、安置补助费；4、缴纳的耕地占用税或城镇土地使用税、土地登记费及征地管理费等；5、征地动迁费；包括征用土地上的房屋及附属构筑物、城市公共设施等拆除、迁建补偿费、搬迁运输费，企业单位因搬迁造成的减产、停工损失补贴费，拆迁管理费等等；6、水利水电工程水库淹没处理补偿费；包括农村移民安置迁建费，城市迁建补偿费，库区工矿企业、交通、电力、通信、广播、管网、水利等的恢复、迁建补偿费用，库底清理费，防护工程费，环境影响补偿费用等。
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关于征地补偿纠纷，法律处理方式主要有行政诉讼、行政复议、行政复议裁决、民事诉讼、征地补偿协调、裁决等方式，根据个案的不同特点应当启动不同的法律程序。
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征地补偿报市、县人民政府批准后，对补偿标准有争议的，可以向县级以上地方人民政府申请协调；协调不成的，由批准征收土地的人民政府裁决。